A súlyosan környezetszennyező és nem szelektív kémiai szúnyogirtás a védett területeken nem alkalmazható, ugyanakkor a lakott területek közelében még ezt használják Magyarországon. Emiatt egyrészt csökken a madarak számára a rovartáplálék mennyisége, illetve a méreganyagokkal szennyezett legyeket, méheket, szúnyogokat elfogyasztó kétéltűek, hüllők és madarak elpusztulhatnak. Feltételezések szerint ez lehet az egyik oka, hogy a repülő rovarokra vadászó molnárfecske hazai állománya a felére csökkent. A szúnyogirtást követően megfigyeltek már konkrét madárelhullásos eseteket is – olvasható a Magyar Madártani és Természetvédelmi Egyesület honlapján. A meleg ködképzéssel történő földi irtás pedig a szervezetre is ártalmas, ugyanis a lebegő párával beszívja a méreganyagot az ember.
Csuja László elmondta amellett, hogy a kémiai szúnyoggyérítés ártalmas az emberi szervezetre, hatékonyatlanabb és gazdaságtalanabb is, mint a biológiai irtás. Magyarország települései azonban, azért választják ezt a módszert, mert az állam viseli annak költségeit. A szúnyogirtással foglalkozó vállalatoknak pedig jobban megéri a drága kémiai szerekkel permetezni, mint a biológiai módszert választani. A biológus kiemelte, azért ellenpélda is van az országban, hiszen Szegeden például már évek óta megoldott a biológiai gyérítés.